于子宫内膜异位症的发生机制有以下几种学说：

①Sampson学说。即月经血倒流学说。月经血经输卵管倒流，引起子宫内膜碎片异位播散而种植于盆腔组织及其他脏器。

②体腔上皮化生学说：女性生殖系统上皮、卵巢生殖上皮及盆腔腹膜均起源于体腔上皮，当受到炎症、创伤、雌激素过高等因素的影响时，可使体腔上皮化生而成子宫内膜样组织，80％的子宫内膜异位症发生在卵巢，与卵巢生发上皮的化生潜能有关。但目前很多学者认为腹膜刺激合并子宫内膜异位症是果而不是因，而且腹膜刺激都发生在异位灶以外的部位。

③淋巴及静脉播散学说：是指子宫内膜碎屑通过淋巴或静脉播散至远离盆腔的器官如腹膜后淋巴结、输尿管、肺、胸膜、大腿、手、臀、淋巴结等组织。

④直接种植：是指直接将子宫内膜带至腹壁手术切口，或宫颈、阴道、会阴伤口等处，是医源性种植。如剖腹取胎术后可见腹壁疤痕子宫内膜异位症，或分娩后会阴切开处发生子宫内膜异位症等。

⑤基因学说：某些子宫内膜异位症患者，在其家属中同病的发生率较一般妇女为多，因而推测可能有遗传基因的存在。

⑥Koninckx等学说：最近Koninckx等提出在于宫内膜异位症患者中常合并黄素化未破裂卵泡综合征（luteinized unruptuted follicle syndrome，简称LUFS）。由于LUFS，卵泡未破裂，腹水内雌、孕激素的浓度低，有利于子宫内膜细胞种植而易发生子宫内膜异位症，此学说尚待进一步证实。

⑦免疫学学说：现已证实妇女细胞免疫缺陷易发生子宫内膜碎片移位、种植而发生子宫内膜异位症。