经阴道（阴道内）超声波普查对子宫和卵巢的影像具有更高分辨率。能观察到整个子宫，以确定有无子宫内膜癌的存在。这种超声波检查能发现“扪诊”所不能发现的卵巢癌。操作方法是，将一个小小的探头放入阴道，探头发出超声波，产生组织影像。可疑癌肿的征象为：“肿块”和“血流改变”（速度减慢）征。

　　三维（不是二维）多普勒影像已有过试验，其能明显提高普查方法的特异性。这种技术能更准确区分良性（benign）肿瘤与恶性（malignant）肿瘤。

　　目前，经阴道超声波普查的特异性和敏感性还不太高，还不能大大降低普通人群的死亡率。用这种方法普查那些不太常见的肿瘤（如卵巢癌）的花费较大，但是对卵巢癌的高危人群还是值得用此种方法进行普查。高危人群是指，具有乳腺癌、卵巢癌家族史和（或）携带有BRCA-1或BRCA-2突变基因的妇女。