非淋菌性尿道炎虽然症状较淋病轻，但危害并不比淋病轻。由于症状较轻，很多患者失去了治疗的最佳时期，从而使治疗非常困难，本病尤其在女性中症状极其轻微，而女性感染者由于症状轻微往往不予治疗，增加了本病传播的机会。

　　本病除引起尿道炎外，在女性约一半以上的患者有合并症，如子宫内膜炎、输卵管炎、宫外孕、不育症和流产。根据临床观察，非淋感染久治不愈的原因大致有以下几点：

　　1 ）　第一次的治疗不彻底，只是感觉症状消失了，没有作相关检查就误认为痊愈而停止用药，其实病原体并没有被完全杀死。建议非淋感染用药治疗不应该少于两周，治疗结束后应该做相关检查以确定完全治愈。

　　2 ）　衣、支原体一旦上行感染到前列腺，症状表现呈慢性化过程，很多患者治疗心切，频繁交替使用大量高效抗生素，结果导致耐药性的产生，或出菌群紊乱甚至导致霉菌二重感染，症状因此加重。

　　3 ）　女性患本病后因症状不明显不易被发现，因此在治疗时没有同时治疗，一方治疗痊愈后，由于密切接触而重复交叉感染。

　　4 ）　用药量不足或时间不够，不能达到有效治疗，反而使病菌产生耐药。

　　5 ）　在治疗过程中没有注意饮食禁忌。大量的烟酒、辛辣等饮食刺激性导致炎症复发或缠绵难愈，因此在治疗过程中应不饮酒，少吃或不吃辛辣刺激食物。